Hoàn thuế GTGT 2026 : Điều kiện, hồ sơ và thủ tục mới nhất

Hoàn thuế GTGT là một trong những nghiệp vụ quan trọng giúp doanh nghiệp thu hồi nguồn vốn, giảm áp lực tài chính và đảm bảo dòng tiền hoạt động ổn định. Tuy nhiên, kể từ ngày 01/07/2025, Luật Thuế giá trị gia tăng số 48/2024/QH15 chính thức có hiệu lực, cùng với Nghị định 181/2025/NĐ-CP hướng dẫn thi hành đã có nhiều thay đổi đáng chú ý về đối tượng, điều kiện và thủ tục hoàn thuế. Bài viết dưới đây phần mềm kế toán MISA SME sẽ tổng hợp chi tiết các quy định mới nhất về hoàn thuế GTGT để kế toán và doanh nghiệp nắm bắt, áp dụng đúng quy định.

1. Hoàn thuế GTGT là gì?

Hoàn thuế GTGT (hoàn thuế giá trị gia tăng) là việc Ngân sách Nhà nước trả lại cho cơ sở kinh doanh hoặc tổ chức, cá nhân số tiền thuế GTGT đầu vào đã nộp nhưng chưa được khấu trừ hết, hoặc số thuế đã nộp thừa, hoặc số thuế thuộc đối tượng được hoàn theo quy định pháp luật.

Bản chất của hoàn thuế GTGT là một cơ chế điều tiết của Nhà nước nhằm:

• Bảo đảm tính trung lập của thuế GTGT, tránh tình trạng thuế chồng thuế.
• Khuyến khích hoạt động xuất khẩu và đầu tư mở rộng sản xuất kinh doanh.
• Hỗ trợ doanh nghiệp duy trì dòng tiền và năng lực cạnh tranh.

Ví dụ: Doanh nghiệp A trong quý III/2025 phát sinh thuế GTGT đầu vào của hàng hóa xuất khẩu là 500 triệu đồng, chưa được khấu trừ hết sau khi bù trừ với thuế GTGT đầu ra của hàng tiêu thụ nội địa. Trong trường hợp này, doanh nghiệp A đủ điều kiện đề nghị hoàn thuế GTGT theo quy định.

2. Quy định mới nhất về hoàn thuế GTGT năm 2026

Căn cứ pháp lý mới nhất điều chỉnh hoạt động hoàn thuế GTGT bao gồm:

• Luật Thuế giá trị gia tăng số 48/2024/QH15 (có hiệu lực từ ngày 01/07/2025).
• Nghị định 181/2025/NĐ-CP quy định chi tiết một số điều của Luật Thuế GTGT.
• Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14 và Thông tư 80/2021/TT-BTC về trình tự, thủ tục hoàn thuế.

2.1. Các trường hợp được hoàn thuế GTGT

Theo Điều 15 Luật Thuế GTGT số 48/2024/QH15, các trường hợp được hoàn thuế GTGT bao gồm 8 nhóm đối tượng:

(1) Hoàn thuế đối với hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu

Cơ sở kinh doanh trong tháng, quý có hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu nếu có số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế theo tháng, quý. Trường hợp ngoại lệ: hàng hóa nhập khẩu sau đó xuất khẩu sang nước khác không thuộc diện hoàn thuế.

(2) Hoàn thuế đối với dự án đầu tư

Cơ sở kinh doanh nộp thuế theo phương pháp khấu trừ có dự án đầu tư mới hoặc đầu tư mở rộng (bao gồm cả dự án chia thành nhiều giai đoạn, hạng mục), nếu trong giai đoạn đầu tư có số thuế giá trị gia tăng đầu vào phát sinh trong giai đoạn đầu tư mà chưa được hoàn thuế thì cơ sở kinh doanh thực hiện bù trừ với số thuế giá trị gia tăng phải nộp của hoạt động sản xuất, kinh doanh đang thực hiện (nếu có). Sau khi bù trừ nếu số thuế giá trị gia tăng đầu vào của dự án đầu tư chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế giá trị gia tăng.

(3) Hoàn thuế đối với hàng hóa, dịch vụ chịu thuế suất 5%

Cơ sở kinh doanh chỉ sản xuất hàng hóa, cung cấp dịch vụ chịu thuế suất 5% nếu có số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên sau 12 tháng liên tục hoặc 04 quý liên tục thì được hoàn thuế.

(4) Hoàn thuế khi giải thể, phá sản

Cơ sở kinh doanh nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ được hoàn thuế khi giải thể, phá sản nếu có số thuế GTGT nộp thừa hoặc số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết.

Trường hợp tổ hợp tác nộp thuế theo phương pháp khấu trừ thuế chuyển đổi thành hợp tác xã thì hợp tác xã được kế thừa số thuế giá trị gia tăng nộp thừa hoặc số thuế giá trị gia tăng đầu vào chưa được khấu trừ hết của tổ hợp tác để khấu trừ, hoàn thuế theo quy định.

(5) Hoàn thuế đối với hàng hóa mua tại Việt Nam mang theo khi xuất cảnh

Áp dụng cho người nước ngoài, người Việt Nam định cư ở nước ngoài (trừ thành viên Tổ bay, Đoàn thủy thủ) mang hộ chiếu hoặc giấy tờ có giá trị đi lại quốc tế được hoàn thuế đối với hàng hóa mua tại Việt Nam mang theo khi xuất cảnh

(6) Hoàn thuế đối với chương trình, dự án sử dụng vốn ODA, viện trợ không hoàn lại, viện trợ nhân đạo

Áp dụng cho chủ chương trình, dự án; nhà thầu chính; tổ chức được nhà tài trợ chỉ định quản lý;dự án sử dụng vốn ODA không hoàn lại được hoàn số thuế giá trị gia tăng đã trả cho hàng hóa, dịch vụ mua tại Việt Nam để phục vụ cho chương trình, dự án;

Tổ chức ở Việt Nam sử dụng tiền viện trợ không hoàn lại, tiền viện trợ nhân đạo của tổ chức, cá nhân nước ngoài để mua hàng hóa, dịch vụ phục vụ cho chương trình, dự án viện trợ không hoàn lại, viện trợ nhân đạo tại Việt Nam thì được hoàn số thuế giá trị gia tăng đã trả cho hàng hóa, dịch vụ đó

(7) Hoàn thuế đối với đối tượng được hưởng quyền ưu đãi miễn trừ ngoại giao

(8) Hoàn thuế theo quyết định của cơ quan có thẩm quyền hoặc điều ước quốc tế mà Việt Nam là thành viên.

2.2. Các trường hợp KHÔNG được hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư

Theo khoản 3 Điều 30 Nghị định 181/2025/NĐ-CP, có 04 trường hợp doanh nghiệp không được hoàn thuế GTGT mà phải kết chuyển sang kỳ tiếp theo, gồm:

• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh không góp đủ số vốn điều lệ như đã đăng ký tại thời điểm nộp hồ sơ hoàn thuế.
• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện khi chưa đủ các điều kiện kinh doanh theo quy định pháp luật.
• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện không bảo đảm duy trì đủ điều kiện kinh doanh trong quá trình hoạt động (bị thu hồi giấy phép, giấy chứng nhận, văn bản chấp thuận…).
• Dự án đầu tư khai thác tài nguyên, khoáng sản (không bao gồm dự án thăm dò, phát triển mỏ dầu khí) và dự án đầu tư sản xuất sản phẩm là tài nguyên, khoáng sản đã chế biến thành sản phẩm khác theo quy định.

2.3. Điều kiện được hoàn thuế GTGT

Căn cứ Điều 37 Nghị định 181/2025/NĐ-CP, cơ sở kinh doanh muốn được hoàn thuế GTGT phải đáp ứng đồng thời các điều kiện sau:

• Là cơ sở kinh doanh nộp thuế theo phương pháp khấu trừ.
• Lập và lưu giữ sổ kế toán, chứng từ kế toán theo quy định pháp luật về kế toán.
• Có tài khoản tiền gửi ngân hàng theo mã số thuế của cơ sở kinh doanh.
• Đáp ứng quy định về khấu trừ thuế GTGT đầu vào và không thuộc trường hợp không đáp ứng quy định về khấu trừ.
• Người bán đã kê khai, nộp thuế GTGT theo quy định đối với hóa đơn đã xuất cho cơ sở kinh doanh đề nghị hoàn thuế.

Lưu ý: Đây là điểm mới rất quan trọng của Nghị định 181/2025/NĐ-CP. Trường hợp người bán chưa nộp đầy đủ hồ sơ khai thuế GTGT hoặc còn nợ tiền thuế GTGT của kỳ tính thuế tương ứng, thì cơ sở kinh doanh không được hoàn thuế đối với các hóa đơn tương ứng. Điều này đòi hỏi doanh nghiệp cần thận trọng trong việc lựa chọn nhà cung cấp và đối soát thông tin kê khai thuế của người bán.

2.4. Thời hạn giải quyết hồ sơ hoàn thuế GTGT

Theo Điều 75 Luật Quản lý thuế 2019 quy định như sau: